Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACNA1SQ13698 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACNA1SQ13698 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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