Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PMS2P11Q13670 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms