Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DNASE1L3Q13609 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DNASE1L3Q13609 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms