Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PKD2Q13563 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PKD2Q13563 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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