Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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TUBB3Q13509 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TUBB3Q13509 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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