Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GPM6BQ13491 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms