Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TOP3AQ13472 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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