Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LSAMPQ13449 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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