Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PAPPAQ13219 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
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PAPPAQ13219 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PAPPAQ13219 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PAPPAQ13219 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PAPPAQ13219 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPPAQ13219 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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PAPPAQ13219 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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PAPPAQ13219 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPPAQ13219 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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