Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TFCP2Q12800 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms