Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TEFQ10587 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TEFQ10587 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TEFQ10587 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms