Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FOXM1Q08050 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms