Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CALD1Q05682 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms