Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IFITM3Q01628 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms