Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CTBSQ01459 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CTBSQ01459 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms