Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCN7AQ01118 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms