Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
MYBPC1Q00872 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms