Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms