Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC12A2P55011 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms