Protein–RNA interactions for Protein: P52272

HNRNPM, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein M, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPMP52272 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.345e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SLC43A3-209ENST00000528098 1260 ntTSL 223.45■■□□□ 1.345e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TOP1MT-203ENST00000517857 624 ntTSL 222.7■■□□□ 1.225e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 XRCC3-203ENST00000553332 560 ntTSL 322.62■■□□□ 1.215e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-207ENST00000466629 463 ntTSL 222.53■■□□□ 1.21e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.155e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SLC43A3-212ENST00000529113 541 ntTSL 521.63■■□□□ 1.055e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 XRCC3-212ENST00000555231 582 ntTSL 321.41■■□□□ 1.025e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 321.04■□□□□ 0.965e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.965e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 AP000781.2-201ENST00000534081 1639 ntTSL 220.66■□□□□ 0.95e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.845e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.815e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.85e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.793e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.762e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-210ENST00000634296 2328 ntTSL 519.74■□□□□ 0.751e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 AL449266.1-201ENST00000357393 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.549e-10■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 RPL28-202ENST00000426763 5620 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.545e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 NUDCD3-206ENST00000475952 983 ntTSL 217.99■□□□□ 0.475e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.415e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC17.39■□□□□ 0.375e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.375e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-202ENST00000344297 5861 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SLC43A3-202ENST00000395123 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.345e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-214ENST00000634810 5825 ntTSL 1 (best)17.07■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 XRCC3-216ENST00000556682 535 ntTSL 417.07■□□□□ 0.325e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-202ENST00000375305 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SLC43A3-201ENST00000352187 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-203ENST00000400366 6304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -03e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-204ENST00000400370 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.111e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-213ENST00000634620 5653 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-201ENST00000242839 6638 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.215e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PTPRVP-201ENST00000482597 3999 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.265e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-215ENST00000634844 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 NUDCD3-209ENST00000487118 314 ntTSL 312.73□□□□□ -0.373e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-211ENST00000634308 4321 ntTSL 1 (best)12.43□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-205ENST00000418097 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ANKRD17-208ENST00000559367 539 ntTSL 511.77□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ATP7B-206ENST00000448424 6404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)11.15□□□□□ -0.625e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-204ENST00000433829 591 ntTSL 39.8□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.173e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.253e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-212ENST00000636777 652 ntTSL 55.58□□□□□ -1.525e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 MAPK8-215ENST00000476134 732 ntTSL 35.46□□□□□ -1.545e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SORT1-202ENST00000466471 521 ntTSL 24.81□□□□□ -1.645e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 GDI2-205ENST00000447751 834 ntTSL 34.73□□□□□ -1.655e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 FANCC-207ENST00000474949 841 ntTSL 54.59□□□□□ -1.675e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TSNARE1-202ENST00000518720 583 ntTSL 426.29■■□□□ 1.85e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TSNARE1-206ENST00000520462 589 ntTSL 424.08■■□□□ 1.455e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SETD5-214ENST00000463180 685 ntTSL 231.39■■■□□ 2.623e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 324.8■■□□□ 1.563e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SETD5-207ENST00000415650 579 ntTSL 421.63■■□□□ 1.053e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SETD5-221ENST00000478475 477 ntTSL 412.9□□□□□ -0.343e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.363e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 STRBP-203ENST00000407982 2751 ntTSL 1 (best)26.57■■□□□ 1.843e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.613e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 AC074091.1-201ENST00000505973 1741 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.51e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-204ENST00000416005 3515 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-202ENST00000379717 3417 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.271e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-208ENST00000556601 3543 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.371e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-203ENST00000413371 3703 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-201ENST00000355467 3541 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.591e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ZNF512-207ENST00000494548 505 ntTSL 29.52□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.663e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CREBBP-202ENST00000382070 7598 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.173e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 IGF2BP3-213ENST00000491719 800 ntTSL 533.66■■■□□ 2.983e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 IGF2BP3-207ENST00000468263 706 ntTSL 226.44■■□□□ 1.823e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 IGF2BP3-210ENST00000476938 500 ntTSL 225.52■■□□□ 1.683e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 IGF2BP3-202ENST00000421467 2988 ntTSL 514.07□□□□□ -0.163e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PAWR-205ENST00000548075 592 ntTSL 411.73□□□□□ -0.532e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTAGE5-214ENST00000556148 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.077e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTAGE5-205ENST00000348007 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.377e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TTC21B-203ENST00000464374 1844 ntTSL 1 (best)10.26□□□□□ -0.773e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.053e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 234.53■■■■□ 3.121e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TRAPPC10-203ENST00000422875 5267 ntTSL 1 (best)22.05■■□□□ 1.125e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TBL1XR1-207ENST00000428970 575 ntTSL 417.34■□□□□ 0.375e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TBL1XR1-220ENST00000630796 656 ntTSL 511.12□□□□□ -0.635e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.985e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 14e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.814e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.84e-7■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 SUN1-207ENST00000419312 473 ntTSL 425.31■■□□□ 1.642e-8■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-206ENST00000460976 603 ntTSL 542.06■■■■■ 4.321e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.051e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-208ENST00000476817 705 ntTSL 333.3■■■□□ 2.921e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.021e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.931e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-212ENST00000530884 578 ntTSL 317.57■□□□□ 0.41e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 CTBP2-203ENST00000337195 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PRPSAP1-203ENST00000435555 916 ntTSL 515.78■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 20.3
HNRNPMP52272 PRPSAP1-201ENST00000324684 1678 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.032e-6■■■■□ 20.3
Retrieved 100 of 21,363 protein–RNA pairs in 317.7 ms