Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GNPDA1P46926 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GNPDA1P46926 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms