Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ACTR1BP42025 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms