Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GJC1P36383 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms