Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PCSK1P29120 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms