Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GJB2P29033 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GJB2P29033 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms