Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SSFA2P28290 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SSFA2P28290 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms