Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CHMLP26374 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CHMLP26374 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms