Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTX3P26022 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTX3P26022 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PTX3P26022 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms