Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LMO1P25800 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LMO1P25800 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LMO1P25800 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms