Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VCLP18206 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VCLP18206 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VCLP18206 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VCLP18206 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms