Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
XBP1P17861 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
XBP1P17861 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
XBP1P17861 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms