Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ACADSP16219 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms