Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
C8orf88P0DMB2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms