Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PKHD1P08F94 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms