Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HLA-HP01893 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms