Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
POP4O95707 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POP4O95707 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
POP4O95707 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
POP4O95707 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
POP4O95707 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
POP4O95707 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
POP4O95707 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
POP4O95707 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms