Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
EIF5BO60841 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF5BO60841 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms