Protein–RNA interactions for Protein: O60225

SSX5, Protein SSX5, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX5O60225 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SSX5O60225 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms