Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DENRO43583 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DENRO43583 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DENRO43583 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
DENRO43583 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms