Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNQ3O43525 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNQ3O43525 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms