Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LAMA5O15230 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LAMA5O15230 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms