Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ANKRD28O15084 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD28O15084 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms