Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
J3QRK9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
J3QRK9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms