Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC01387J3KSC0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms