Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ERVV-1B6SEH8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms