Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC4A4Q9Y6R1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms