Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SUPT16HQ9Y5B9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms