Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF330Q9Y3S2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms