Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
HDGFL3Q9Y3E1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms