Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SBNO2Q9Y2G9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms